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LncRNA测序

LncRNA测序是研究已有参考基因组的物种的特定组织或细胞在某个时期转录出来的所有LncRNA和mRNA的研究方法。
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LncRNA测序
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关键词:
LncRNA
长链非编码RNA
LncRNA测序
1
产品描述

产品简介:

  LncRNA(long non-coding RNAs):又称为长链非编码RNA,是一类长度大于200nt但不编码蛋白质的RNAs,广泛存在于动植物中。它们曾长期被误认为是遗传暗物质,但近些年研究证实这类RNAs在生物的生命活动过程中起着重要的调控作用。LncRNA测序是研究已有参考基因组的物种的特定组织或细胞在某个时期转录出来的所有LncRNA和mRNA的研究方法。

项目流程:

005LncRNA测序1

信息分析:

 LncRNA信息分析图替换.

分析结果展示:

LncRNA测序

研究领域:

  • 细胞分化和生长发育研究
  • 调控机理研究
  • 动植物抗性及适用性机制研究
  • 疾病标志物筛选

技术参数:

LncRNA技术参数图替换

研究思路:

005LncRNA测序13

期刊:Plant Journal,IF:6.141发表时间:2019.7,研究单位:中国农业大学

研究结论:

  在不同的光照条件下,通过不同的调控机制调控花青素的积累,在白光和蓝光的处理下,苹果通过调控LncRNA MLNC3.2和MLNC4.6的表达竞争性的结合miR156a,从而保证SPL转录因子的正常表达,保证与MdMYB1的结合形成复合物促进花青素相关基因的表达。该文章利用代谢组学数据(花青素含量检测)以及LncRNA和miRNA的测定,最终确定了在白光光照条件下苹果积累花青素的机制,为之后其他物种中研究颜色积累的机制提供参考。

005LncRNA测序14

图1 不同光照处理之后苹果果皮颜色变化及花青素的积累情况

 

005LncRNA测序15

图2.不同光照调控苹果颜色积累的机制模拟图

参考文献:

  Yang T , Ma H , Zhang J , et al. Systematic identification of long noncoding RNAs expressed during light‐induced anthocyanin accumulation in apple fruit[J]. The Plant Journal, 2019.

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