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PRM目标定量蛋白组

PRM技术根据含有目标蛋白和肽段的样品或者合成的标准肽段建立的谱图库,建立针 对目标蛋白和肽段的特定的质谱采集 方法,对样品中的目标肽段进行监测,实现相对或绝对定量。
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所属分类
PRM蛋白组
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PRM
靶向蛋白
目标定量蛋白组
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产品描述

产品介绍:

  PRM(平行反应监测,Parallel Reaction Monitoring)是目前靶向蛋白质组学数据采集的主流方法,通过对特异性肽段或目标肽段(如发生翻译后修饰的肽段)进行选择性检测,从而实现对目标蛋白质/修饰肽段的靶向相对定量,通过合成同位素标准肽段,绘制标准曲线,可以实现目标蛋白质的绝对定量(可选)。PRM技术是在多反应监测(multiple reaction monitoring, MRM)技术的基础上演化而来的。它基于高分辨、高精度质谱(如Q-Exactive HF-X等),首先利用四级杆质量分析器的选择检测能力,在一级质谱中(Q1)选择性地检测目标肽段的母离子信息;随后在HCD碰撞池中碎裂;最后进入高分辨、高质量精度分析器中,检测所选择的母离子窗口内的所有碎片的信息。这样即可对复杂样本中的目标蛋白质/肽段进行准确地特异性分析。PRM常用于验证定量蛋白质组学/翻译后修饰蛋白质组学结果,或直接对目标蛋白质进行相对/绝对定量分析。

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PRM实验原理示意图

技术优势:

  (1) 质量精度达到ppm级,能够比传统的SRM/MRM更好地排除背景干扰和假阳性,有效提高复杂背景下的检测限和灵敏度;
  (2) 对子离子进行全扫描,无需选择离子对和优化碎裂能量,更容易进行方法学建立;
  (3) 更宽的线性范围:增加至5-6个数量级;
  (4) 通量高:一次检测50个蛋白,不依赖抗体;

应用方向:

  ♦ 医学研究
  疾病机理机制研究 诊断分子标志物 药物靶点
  ♦ 动物研究
  动物生殖发育机制 动物疾病机理 动物营养代谢与调控 动物毒理研究
  ♦ 植物研究
  植物生殖发育机制 非生物胁迫应答机理 植物抗病机理 作物改良
  ♦ 微生物
  致病机制及耐药性研究 胁迫相关蛋白筛查及机制研究 环境作用机理

样本要求:
 


研究思路:

  A Targeted Proteomic Approach for Heat Shock Proteins Reveals DNAJB4 as a Suppressor for Melanoma Metastasis

  期刊:Cell Rep.,发表时间:2018.06,影响因子:6.986

研究背景:

  热休克蛋白(HSP)是分子伴侣,在蛋白质折叠/展开,细胞周期调节和细胞的保护中起作用。对热休克蛋白的全面分析将有助于药物发现和癌症治疗。当前研究热休克蛋白的方法依赖于低通量蛋白质印迹分析。虽然质谱法已广泛用于蛋白质组学分析,但尚未开发出分析方法来对热休克蛋白进行蛋白质组的检测。

研究思路:

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研究结果:

  本研究首次开发了一种高通量和强大的基于PRM的靶向蛋白质组学方法,用于定量分析人类热休克蛋白质组。可以预见的是,该方法通常适用于评估细胞通过改变热休克蛋白的表达对细胞外刺激的反应(例如,暴露于环境有毒物质或热激蛋白抑制剂后)。

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