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真核转录组测序

转录组测序,指利用高通量测序技术,全面快速获取某一物种特定组织或器官在某一状态下的所有mRNA的序列信息。并对mRNA的结构和表达信息进行分析。
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关键词:
转录组
转录组测序
RNA-Seq
mRNA
1
产品描述

产品简介:

  转录组,广义上指某一生理条件下,细胞内所有转录产物的集合,包括mRNA,rRNA,tRNA以及其他non coding RNA,狭义上指mRNA 集合。真核转录组测序,采用二代高通量测序平台,对动植物样本转录的mRNA进行测序,获得基因的定量信息,进行基因注释,并进行差异分组间的差异分析,富集分析。结构方面可进行可变剪切,新基因预测等分析。

项目流程:

001真核转录组测序

信息分析:

真核转录组测序信息分

分析结果展示:

01-真核转录组-官网3

研究领域:

  • 动植物生长发育机制研究
  • 动植物抗性及适用性机制研究
  • 不同器官基因表达模式研究

技术参数:

真核转录组测序技术参数

研究思路:

001真核转录组测序12

发表期刊:Journal of Agricultural and Food Chemistry。影响因子:5.279
发表时间:2021.09。发表单位:南京农业大学生命科学学院

001真核转录组测序13

研究结论:

  本研究首次研究了6个藜麦品种在不同萌发时间(种子、G24、G48和G72)下GABA含量、GABA相关代谢物含量和酶活性的变化。通过转录组测序,探讨了藜麦萌发过程中GABA积累的分子机制。本研究的结果拓展了我们对藜麦萌发过程中生物活性化合物特别是GABA变化的认识,为开发高GABA含量的新型功能食品提供了理论依据。

参考文献:

  Zhang Derui,Wei Xiaonan,Liu Ze et al. Chenopodium quinoaTranscriptome Analysis Reveals the Molecular Mechanism of GABA Accumulation during Quinoa ( Willd.) Germination.[J] .J Agric Food Chem, 2021, 69: 12171-12186.

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