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宏基因组
宏基因组测序是指对微生物全部基因片段进行测序的研究方法,它能够同时检测样本中的所有微生物信息。可用于研究样本中微生物群落组成,丰度差异、功能活性、以及与环境之间的协作关系。
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扩增子
扩增子测序是一种通过引物对特定区域进行扩增,再对特定长度PCR产物或者捕获片段进行测序,可用于研究样本中微生物群落组成及其丰度差异。根据研究对象的不同可分为16S/ITS/18S测序。16S测序可以鉴定特定环境中细菌的种类和丰度,ITS/18S测序可以鉴定特定环境中真菌/藻类的种类和丰度。
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代谢组+蛋白组
蛋白质组学可以对样品之间的蛋白质水平的变化进行定量比较,代谢组学检测样本中所有代谢物,通过蛋白组和代谢组联合分析,可系统全面地解析生物分子功能和调控机制。
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代谢组+重测序
mGWAS(metabolome Genome-Wide Association Study):代谢物的种类和数量在不同品种与组织中存在很大差异。利用二代测序技术获得群体材料的基因型数据(Genotype),结合代谢组数据(Metabolome),开展代谢物的全基因组关联分析,批量精确定位控制代谢表型(品质、功能营养分子等)相关候选基因,挖掘调控营养和品质等相关代谢通路机理,将有助于我们深入了解代谢遗传机制,加快培育优质新品种。
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转录组+代谢组
转录组+代谢组,基于代谢组和转录组数据,开展表达基因(mRNA),代谢物积累的相关分析。差异积累的代谢物信息可辅助时序表达的众多基因进行“共表达”分析,构建核心调控网络,找出关键候选基因,阐述生物学现象。
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转录组+蛋白质组+代谢组
转录组+蛋白质组+代谢组,对特定时期特定样本分别进行转录组测蛋白质组检测和代谢物检测。从遗传信息、蛋白功能或代谢通路阐释复杂的生物网络调控。
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